Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLDN25C9JDP6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN25C9JDP6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms