Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf172C9J069 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf172C9J069 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf172C9J069 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf172C9J069 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf172C9J069 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf172C9J069 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf172C9J069 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf172C9J069 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf172C9J069 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C9orf172C9J069 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms