Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4E171 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4E171 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4E171 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4E171 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4E171 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4E171 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4E171 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4E171 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
B4E171 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4E171 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4E171 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4E171 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4E171 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4E171 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4E171 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4E171 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4E171 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4E171 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4E171 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4E171 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4E171 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4E171 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4E171 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4E171 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4E171 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4E171 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4E171 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4E171 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4E171 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4E171 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
B4E171 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4E171 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4E171 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4E171 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4E171 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4E171 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4E171 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4E171 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4E171 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4E171 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4E171 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4E171 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4E171 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4E171 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
B4E171 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4E171 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4E171 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B4E171 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4E171 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
B4E171 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4E171 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4E171 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4E171 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4E171 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4E171 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4E171 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4E171 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4E171 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms