Protein–RNA interactions for Protein: A7E2V4

ZSWIM8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM8A7E2V4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZSWIM8A7E2V4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZSWIM8A7E2V4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZSWIM8A7E2V4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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