Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCT8L1PA6NM43 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT8L1PA6NM43 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms