Protein–RNA interactions for Protein: A6NLC5

C3orf70, UPF0524 protein C3orf70, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf70A6NLC5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C3orf70A6NLC5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf70A6NLC5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf70A6NLC5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf70A6NLC5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf70A6NLC5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf70A6NLC5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf70A6NLC5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms