Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF233A6NK53 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF233A6NK53 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms