Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC154A6NI56 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC154A6NI56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms