Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf118A6NHY6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf118A6NHY6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf118A6NHY6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf118A6NHY6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf118A6NHY6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms