Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SERINC4A6NH21 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERINC4A6NH21 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms