Protein–RNA interactions for Protein: A6NG13

MGAT4D, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein MGAT4D, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4DA6NG13 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MGAT4DA6NG13 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MGAT4DA6NG13 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms