Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCAF2A6NFQ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCAF2A6NFQ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCAF2A6NFQ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.7 ms