Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBFOX3A6NFN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBFOX3A6NFN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms