Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIT2A6NDA9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRIT2A6NDA9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms