Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRD1A4D1F6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRD1A4D1F6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRD1A4D1F6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms