Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ISPDA4D126 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ISPDA4D126 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms