Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM89A2RUT3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM89A2RUT3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms