Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMX2A2RU54 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMX2A2RU54 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HMX2A2RU54 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms