Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPDC1A2A3K4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPDC1A2A3K4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms