Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LNP1A1A4G5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LNP1A1A4G5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms