Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POTEB3A0JP26 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POTEB3A0JP26 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POTEB3A0JP26 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms