Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBA6A0AVT1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms