Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0U1RQJ8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0U1RQJ8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms