Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0U1RQF3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0U1RQF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0U1RQF3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms