Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X002

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X002 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087X002 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087X002 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087X002 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087X002 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087X002 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087X002 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087X002 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
A0A087X002 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
A0A087X002 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
A0A087X002 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
A0A087X002 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
A0A087X002 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
A0A087X002 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
A0A087X002 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
A0A087X002 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
A0A087X002 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
A0A087X002 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
A0A087X002 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
A0A087X002 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
A0A087X002 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms