Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM17Q9Y577 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM17Q9Y577 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM17Q9Y577 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRIM17Q9Y577 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM17Q9Y577 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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