Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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