Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PHACTR1Q9C0D0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHACTR1Q9C0D0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms