Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TXNDC17Q9BRA2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms