Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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