Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms