Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HDAC11Q96DB2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HDAC11Q96DB2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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