Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-CQ95604 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms