Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113Q902F9 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms