Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CCDC144NLQ6NUI1 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms