Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms