Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SIX1Q15475 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SIX1Q15475 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SIX1Q15475 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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