Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LSAMPQ13449 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LSAMPQ13449 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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