Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HADHBP55084 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HADHBP55084 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms