Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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PGGT1BP53609 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
PGGT1BP53609 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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