Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC3P51654 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC3P51654 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC3P51654 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms