Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJC1P36383 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJC1P36383 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJC1P36383 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GJC1P36383 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms