Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2AP24928 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms