Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCP2P22307 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms