Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 FLJ30679-201ENST00000624773 1980 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CXCL2P19875 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms