Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AP005131.4-202ENST00000590468 570 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ATF2-207ENST00000409833 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TRIM64C-201ENST00000617704 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HOXB1P14653 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms