Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DMDP11532 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DMDP11532 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMDP11532 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 KRT18P45-201ENST00000515347 1333 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMDP11532 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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