Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TMEM225BP0DP42 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms