Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC192P0DO97 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms