Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms